Palestras do PDBFF: Informatics approaches to enable reproducible science

Palestra será ministrada por Matthew B. Jones, que está em Manaus para treinamento na utilização do banco de dados do projeto "Gerenciamento de dados de Projetos Ecológicos de Longa Duração". Dia 10/06/2010 às 17 horas no auditório do BADPI, INPA - Campus II.

O pesquisador Matthew Jones, do National Center for Ecological Analysis and Synthesis - NCEAS, está em Manaus de 5 a 12 de junho para conduzir um treinamento sobre a implantação dos softwares Metacat (um repositório de dados e metadados livre e flexível para armazenar dados científicos, especialmente relacionados com estudos em biologia e ciências ambientais) e Morpho (um editor de metadados). Esses softwares foram desenvolvidos pelo Knowledge Network for Biocomplexity (KNB) e serão utilizados pelos projetos PELD do Brasil. Esse treinamento faz parte do projeto CNPq: Gerenciamento de dados de Projetos Ecológicos de Longa Duração.



Na quinta-feira Matthew ministrará uma palestra para o público em geral no ciclo de palestras do PDBFF.

Informatics approaches to enable reproducible science

Palestrante: Dr. Matthew Jones - Director of Informatics Research & Development. National Center for Ecological Analysis and Synthesis - NCEAS

Data: 10/06/2010. (Quinta-feira)

Hora: 17:00 h

Local: Auditório do BADPI (Campus II-INPA)

Entrada Gratuita

Resumo: Pressures on environmental and ecological systems have stimulated broad scale,interdisciplinary approaches to studying and understanding natural systems. Matthew Jones from NCEAS at UC Santa Barbara will discuss the importance of sharing data and analysis in open, reproducible systems in order to facilitate cross-cutting analysis and modeling approaches. By adopting open science, open data, and open source approaches, we can maximize the utility of scienctific information for environmental policy issues.

Informações: ppbio@inpa.gov.br

Localização de dados que já estão armazenados
na rede KNB (http://knb.ecoinformatics.org/).

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XII Seminário PDBFF: Ricardo Dallarosa

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XI Seminário PDBFF: Anders Gonçalvez

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IX Seminário PDBFF: Fernando Fernandez - resenha

Dr. Fernando Fernandez, no último seminário e com a “casa” cheia, nos brindou com muitas informações sobre dinâmica populacional de pequenos mamíferos em uma paisagem florestal fragmentada da Reserva Biológica de Poço das Antas na Região dos Lagos no Rio de Janeiro. 

Entre muitas coisas, Fernandez nos mostrou diretamente, utilizando-se de técnicas clássicas, como captura e recaptura ou o uso de rádio-colar, como a fragmentação florestal ou eventos drásticos como incêndios florestais podem moldar a estrutura das populações dos organismos que vivem em áreas isoladas ou que perderam o habitat natural. 

Além da percepção espacial, com monitoramento do movimento dos pequenos mamíferos entre fragmentos, permitindo assim inferir sobre o efeito da “insularização” de populações em um mar de capim exótico (uma famosa abstração da própria teoria de Biogeografia de Ilhas). 

A pesquisa também fez com que aumentasse o entendimento do próprio efeito desta matriz exótica, das características de migração ou extinção das populações e da história natural e comportamental destes organismos. Espaço e tempo andam juntos e assim foi interessante também ter visto toda esta problemática dentro da perspectiva temporal, como tais ambientes definem a dinâmica destas populações ao longo do tempo. 
Resultados desta linha de pesquisa podem ser usados didaticamente na formação de estudantes, no aperfeiçoamento do nível de conhecimento ou ir além e mudar a concepção sobre meio-ambiente na cabeça dos tomadores de decisão. Indiretamente, ficou claro que o esforço e a linha de pesquisa de longo prazo colaboraram na capacitação e treino de muitos alunos. 
Certamente e não menos interessantes foram os comentários ou a lembrança que as técnicas apresentadas diferem das técnicas que acompanham as probabilidades de predicção de organismos dentro da ecologia de populações, um assunto familiar para os alunos que atenderam o curso de ecologia de populações dado pelo Prof. Gonçalo Ferraz no programa de pós-graduação da Ecologia do INPA.

Fonte: [José Luís Camargo, PDBFF, 15/05/2009]

Crédito da imagem - Ana Cristina Segalin de Andrade

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X Seminário PDBFF: Susan Laurance

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VII Seminário PDBFF: Gonçalo Ferraz

No último seminário de abril, o Dr. Gonçalo Ferraz provocou a audiência já com o título de sua apresentação: PDBFF, 30 anos e uma pergunta? 
Há mesmo uma pergunta norteadora das atividades do PDBFF? 

A provocação, fruto das discussões que vem sendo travadas nos seminários prévios, foi laureada por um seminário elucidativo que pôde ser dividido em duas partes: (1) a origem do PDBFF baseado na discussão de um conceito – “SLOSS” – que movimentou a cena acadêmica/conservacionista na década de 1970 e uma relação entre este tema e as conquistas científicas que o PDBFF colheu nos últimos 30 anos e mais (2) análises inéditas da investigação que ele anda empenhado nos últimos tempos. 
Segundo o que foi apresentado, o PDBFF faz jus em ter a palavra dinâmica em seu título: as publicações originadas no PDBFF podem ser concentradas em áreas do conhecimento que trataram da: (i) dinâmica dos fragmentos florestais; (ii) dinâmica da matriz de entorno; (iii) dinâmica da borda florestal; (iv) dinâmica da paisagem e (v) dinâmica dos mecanismos que caracterizam os ecossistemas. 
Como gancho e um retorno ao início da apresentação, as novas análises propostas pelo Dr. Ferraz nos remeteu novamente ao conceito de uma grande reserva ou muitas pequenas com o mesmo tamanho (“SLOSS”) pelos olhos da modelagem e da dinâmica de ocorrência de aves no mosaico de reservas do PDBFF. Apenas para aguçar a curiosidade, logo todos terão acesso a este novo artigo e bem provavelmente uma nova discussão sobre SLOSS poderá surgir na literatura.
Fonte: [José Luís Camargo, PDBFF, 30/04/2009]
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IX Seminário PDBFF: Fernando Fernandez

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VI Seminário PDBFF: Mike Hopkins

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Toda sexta no final da tarde tem Seminário PDBFF

Desde março, o PDBFF tem articulado palestras com pesquisadores do Inpa e também de visitantes sobre temas acadêmicos e aplicados - os Seminários PDBFF. O evento acontece toda sexta às 17h no Auditório de Biologia Aquática - BADPI (Inpa). 
O primeiro seminário foi sobre "Fragmentação Florestal afeta reprodução de árvores na Amazônia central?", pelo Dr. José Luis Camargo. A sequência seguiu com Dr. Alberto Vicentini ("Integrando filogenias ao entendimento de espécies e de comunidades vegetais"), Dra. Flávia Costa ("Ecologia Vegetal na Amazônia: Desafios e Oportunidades") e Sir. Gillhean Prance ("49 years with the Chrysobalanaceae"), prestigiado por um auditório lotado.
Os Seminários PDBFF vem trazendo um pouco de ar puro ao promover maior contato entre os pesquisadores que atuam na região, incentivando a discussão e o diálogo, um processo essencial para a vitalidade de qualquer instituição de pesquisa. 
Na próxima sexta (17/04/2009), o Dr. Sérgio Borges (FVA) apresentará o quinto seminário: "Geopolítica da Conservação: entendendo o sistema de áreas protegidas na Amazônia Brasileira". Eu não estarei em Manaus, mas quem puder conferir pode usar o espaço do blog da ULE para publicar seu ponto de vista, comentário ou mesmo uma crônica sobre o seminário. Estou à disposição para ajudar.
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